Спящие споры бактерий попадают в септик или выгребную яму и переходят в активный режим, просыпаясь от контакта с жидкими стоками. В некоторых случаях, перед вводом препарата в канализацию, рекомендуется растворить кристаллы биоактиватора в воде, разбудив бактерии заранее.

После пробуждения колония бактерий начинает активное размножение, используя в качестве питательной массы твердые отходы и придонный ил. По мере роста колонии объёмы илистых и твердых осадков снижаются. Их место занимают жидкие и газообразные продукты биологической переработки.